《实施方案》提出，到2025年，全省农村卫生户用厕所覆盖率达到70%以上，厕所粪便基本得到有效处理，九个高原湖泊（以下简称高原湖泊）覆盖率赤水河流域“九湖”和赤水河流域常住人口100人以上的自然村将达到95%左右，赤水河流域“九湖”和自然村实现卫生公厕全覆盖。 行政村生活污水处理率和收集处理率分别达到40%和15%，农村黑臭水体处理率达到50%，“农村”村生活污水收集处理率“九湖”流域面积达到75%以上。 农村生活垃圾处理设施覆盖率达到80%以上，“九湖”流域实现农村生活垃圾收集、分类、统一运输、集中处理。

在农村厕所建设和质量提升方面，《实施方案》提出，重点以二三类县和“九湖”、赤水河流域为重点，改造建设农村卫生户厕所176万座以上。 改造建设常住人口100人以上的自然村、“九湖”、赤水河流域17000多个卫生公厕。 推进乡村景区旅游厕所建设。 在高寒山区、干旱缺水地区推广节水、低水冲厕设施，或改造符合标准的卫生旱厕。 加强农村厕所改造产品生产、流通领域质量监管，把好采购质量关。

同时，加强农村厕所革命与生活污水处理的有机衔接，鼓励有条件的地区积极推进卫生厕所改造与生活污水处理一体化，推广分散处理、集中处理、集中处理等模式。纳入污水管网，因地制宜统一处理厕所粪便。 鼓励入户、入村、乡镇一体化处理，逐步推动厕所粪便就地农业消费和资源化利用。

在农村污水处理方面，《实施方案》提出推进分区分类处理。 优先开展“九湖”和赤水河流域治理，重点治理集中式饮用水源保护区、黑臭水体集中地区、城市——乡村边缘、中心村、旅游景区等区域。 对人口多、居住集中、水资源丰富的地区，鼓励集中收集处理方式，优先接入城市污水管网，适当建设生活污水处理设施； 对于边远小村庄，则采用生态方法。 应根据情况采取措施。 积极推进农村生活污水资源化利用。

此外，要全面摸清我省农村黑臭水体底数，建立管理台账，明确治理优先顺序，基本消除大面积农村黑臭水体。 针对群众反映强烈的村内河道、池塘、沟渠和黑臭水体，采取源头治理截流、清淤疏浚、生态修复等综合措施，建立水质监测体系针对农村黑臭水体。